Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9930022D16RikQ8BG27 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9930022D16RikQ8BG27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9930022D16RikQ8BG27 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms