Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld4Q8BG07 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms