Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms