Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srgap3Q812A2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srgap3Q812A2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms