Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Atg4cQ811C2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Atg4cQ811C2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Atg4cQ811C2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4cQ811C2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms