Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfascQ810U3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms