Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms