Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amigo1Q80ZD8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amigo1Q80ZD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms