Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrfn4Q80XU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrfn4Q80XU8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrfn4Q80XU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrfn4Q80XU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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