Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc12Q80WJ6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc12Q80WJ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms