Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms