Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms