Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2q1Q7TSS2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms