Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms