Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ShprhQ7TPQ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms