Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms