Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms