Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme8Q715T0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme8Q715T0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms