Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms