Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms