Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms