Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms