Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Glis3Q6XP49 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms