Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms