Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift172Q6VH22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms