Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Atp8b3Q6UQ17 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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