Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms