Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms