Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms