Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasa4Q6PFQ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms