Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms