Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms