Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbtb39Q6PDK0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb39Q6PDK0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms