Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms