Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms