Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms