Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl3Q6P1Y1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms