Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpdc1Q6NZK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms