Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms