Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms