Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms