Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd11Q6NS46 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms