Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt40Q6IFX3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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