Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt42Q6IFX2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt42Q6IFX2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms