Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw2Q6I6G8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw2Q6I6G8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms