Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6GQU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6GQU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms