Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil1Q6EDY6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil1Q6EDY6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms