Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca2Q6DIC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms