Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms