Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms